نوع مقاله : مقاله پژوهشی
نویسندگان
1 بخش شناسایی و ثبت ارقام گیاهی،مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج،ایران
2 استاد گروه زرعت و اصلاح نباتات، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی کرج دانشگاه تهران، ایران
3 دانشیارگروه زرعت و اصلاح نباتات، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی کرج دانشگاه تهران، ایران
چکیده
کلیدواژهها
موضوعات
عنوان مقاله [English]
نویسندگان [English]
Metabolic adaptation to cold stress plays an important role in the growth, survival, and yield of crops. Diamine cadaverine (Cad) as an osmolyte may take part in counteracting the oxidative stress induced by cold stress in chickpea. In this experiment, content of hydrogen peroxide (H2O2), Cad, activity of diamine oxidase (DAO), and its relative gene expression (DAO) in cold-tolerant (Sel96th11439) and cold-sensitive (ILC533) chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes under cold stress (4°C) as a factorial experiment in a completely randomized design (CRD) were studied. In tolerant genotype H2O2 content after a significant increase on the first day of cold stress decreased significantly on the sixth day of cold stress compared to control condition (up to 4.7%), while, its accumulation was observed in sensitive genotype (up to 50%). These results indicated a relative acclimation to cold stress in tolerant genotype. The Cad metabolite content (18 nmol/g FW) was observed under cold stress in tolerant genotype on the sixth day of stress. Under cold stress, in tolerant genotype increasing Cad content was accompanied with an increase in DAO activity and relative expression of DAO gene as biosynthetic pathways of this metabolite (up to 3.5- and 3-fold, respectively). The maximum activity of this route was observed in tolerant genotype on the sixth day of cold stress. In the late responses under cold stress, the accumulation of Cad in tolerant genotype led to reduced cell damage (H2O2 results) and improved cold tolerance. These indices were useful in assessment of chickpea genotypes under cold stress and breeding programs.
کلیدواژهها [English]
1. مقدمه
نخود زراعی (Cicer arietinum L.) گیاهی خودگشن و دیپلوئید (2n=2x=16) محسوب شده و محتوی ژنتیکی نسبتا کوچکی 740 Mbp)) دارد (Varshney et al., 2013). بهطور کلی بذر این گیاه دارای 2/31-4/16 درصد پروتئین، 0/9-6/1 درصد فیبر، 3/73-1/38 درصد کربوهیدرات و 8/6-5/1 درصد چربی است (Mantri et al., 2007). پتانسیل تولید نخود در دنیا 5 تن در هکتار بوده؛ درحالیکه تولید واقعی آن 8/0 تن در هکتار است FAO, 2012)). میزان سطح زیر کشت این گیاه در ایران 500189 هکتار و عملکرد در واحد سطح آن 542 کیلوگرم در هکتار است (آمارنامه کشاورزی 95-1394). پایینبودن عملکرد نخود در ایران، غالباً بهدلیل کشت ارقام کممحصول و حساسیت آن به تنشهای محیطی است.
کشت بهاره نخود زراعی با مشکلاتی از جمله خشکی و کمبود رطوبت آخر فصل همراه است که منجر به کاهشیافتن بهرهوری و تولید تا میزان 400-300 کیلوگرم در هکتار میشود. کشتهای پاییزه یا زمستانه این گیاه باتوجهبه وجود رطوبت امکانپذیر بوده، ولی سرما عامل محدودکننده در توسعه کشت پاییزه نخود محسوب میشود
(Kazemi Shahandashti et al., 2013). بنابراین بهبود تحمل به تنش سرما یکی از برنامههای اساسی بهنژادی در سازگاری، بهبود تولید و عملکرد نخود زراعی است (Heidarvand et al., 2011). در طی تنشهای غیر زیستی از جمله سرما تجمع بیش از حد گونههای اکسیژن فعال (ROS) سبب آسیبهای شدید به ماکرومولکولهای سلولی از جمله تخریب پروتئینها و آنزیمها، و شکستن مولکولهای اسیدنوکلئیک در سلولهای گیاهی میشود (Amini et al., 2017). برای مقابله با ROSها و تنش اکسیداتیو القاشده توسط آنها، فرایند سازگاری به تنش با تغییر میزان متابولیتهای سلولی از طریق تنظیم تظاهر ژنها و فعالیت آنزیمها تغییر میکند (Heidarvand et al., 2013). بنابراین تحت تنشهای محیطی برنامهریزی مجدد بیان ژنها با تغییر الگوی بیان ژنها میتواند سبب تغییر متابولیسم سلولی و هموستازی جدید شود.
H2O2 مولکول پیامرسان حیاتی با قابلیت مشارکت در فرآیندهای فیزیولوژیک گیاهی مانند پاسخ سازگاری به تنشهاست (Dickinson & Forman, 2002). کاداوارین ([1]Cad)، سبکترین عضو خانواده پلیآمینها ([2]PAs) در واقع اسمولیتی پلیکاتیونی است که در پویایی فرآیندهای سلولی، رشد، نمو، تمایز و پاسخ به تنشهای محیطی مشارکت دارد (Handa et al., 2010). این متابولیت از پیشماده لیزین[3] در یک مسیر بیوسنتزی تولید و در ادامه توسط توسط دیآمیناکسیداز (DAO[4]) به آلکالوئیدها تبدیل میشود (Rajpal & Tomar, 2020). آنزیم DAO (EC 1.4.3.6) گروهی از آمیناکسیدازهای ((AOs گیاهی حاوی مس (CuAOs) است (Cona et al., 2006) که با تنظیم میزان PAs، از جمله کاداوارین (Cad) و تجزیه آن به آلکالوئیدها نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای فیزیولوژیک از جمله رشد، نمو، گلدهی، پیری و پاسخ به تنشهای زیستی و غیر زیستی ایفا میکنند
(Angelini et al., 2010; Wimalasekera et al., 2011a,b)؛ فرآیندی که مولکول پیامرسان H2O2 را نیز از طریق کاتابولیسم این PAs تولید میکند (Minocha et al., 2014; Tiburcio et al., 2014).
کاداوارین بهعنوان پلیآمین سبک، علاوهبر ایفای نقش اسموپروتکتنت با حذف رادیکالهای آزاد در تنظیم هموستازی سلول نیز موثر است. همچنین کاداوارین میتواند بهعنوان مولکول سیگنال در تنظیم فعالیتهای سلولی و تحریک بیان ژنهایی که در بازیابی تنش موثرند نیز نقش ایفا کند (Simon-Sarkadi et al., 2014). محتوی کاداورین از طریق القای فعالیت آنزیم لیزیندکربوکسیلاز در مسیر بیوسنتز و نیز ممانعت از فعالیت آنزیم دیآمین اکسیداز ((Cassan et al., 2009 در مسیر تجزیه تجمع مییابد. آمینواسید لیزین پیشساز رایج کاداوارین است (Simon-Sarkadi et al., 2014). در شکل 1 مسیر متابولیک کاداوارین بهطور شماتیک نمایش داده شده است. تغییر محتوی کاداوارین نقش مهمی در پاسخ گیاه به تنشهای غیر زیستی ایفا میکند (Rajpal & Tomar, 2020). تجمع کاداوارین در گونههای مختلف گیاهی متفاوت بوده (Alcazar et al., 2010a) و بهطور معمول محتوی آن تحت تنشهای محیطی افزایش مییابد (Rajpal & Tomar, 2020).
تحت تنشهای محیطی شوری و خشکی افزایش محتوی کاداوارین گیاهی بهعنوان یک حفاظتکننده اسمزی گزارش شده است (Shen & Galston, 1985; Garcia-Garcia et al., 2000; Shalaby, 2000; Carrizo et al., 2001;
Kuznetsov et al., 2009; López-Gómez et al., 2017; Köhler & Szepesi, 2023; Napieraj et al., 2023; Kapoor, 2023; Samanta et al., 2023)؛ بهطوریکه بهموازات جلوگیری از پراکسیداسیون لیپیدها سبب بهبود تحمل به تنشها شده است (Kuznetsov et al., 2007; Sziderics et al., 2010; Simon-Sarkadi., 2014). در پاسخ به تنش گرما، برنج محتوی کاداوارین خود را افزایش داده که بیانگر نقش این پلیآمین در تحمل به تنش گرما است (Kapoor, 2023). این متابولیت بهعنوان تعدیلکننده اسمزی نیز با محافظت از ساختارهای درونسلولی در طی تنشهای محیطی نقش مهمی در بهبود تحمل به تنشهای محیطی در گیاهان دارد (Simon-Sarkadi et al., 2014). از کاداوارین بهعنوان یک نشانگر بیوشیمیایی برای تحمل به تنشهای محیطی استفاده شده (Janmohammadi et al., 2012) و ارتباط مثبت و معنیدار آن با تحمل تنش گزارش شده است (Rajpal & Tomar, 2002). Kuznetsov et al. (2007) گزارش کردند که اسپریپاشی Cad روی بذور گیاهان زراعی با کاهش آثار تنش، جوانهزنی بذر و رشد گیاهچه را تحت تنش شوری تسهیل میکند (Avusoglu et al., 2007; Tomar et al., 2013b).
Alcaloid
|
Lysine |
Cadavarine |
DAO |
H2O2 |
شکل 1. نمایش شماتیک مسیر متابولیک کاداوارین در گیاهان (Moschou et al., 2012).
بیان ژن فرآیند مولکولی حائز اهمیتی است که بین تنوع ژنتیکی و فنوتیپی ارتباط برقرار میکند و تنظیم آن نقش مهمی در تنوع صفتها و تکامل گونهها ایفا میکند .(Wang et al., 2018) همچنین تغییرات بیان ژنها در پایهریزی تنوع فنوتیپ بسیاری از موجودات ایفای نقش میکند.(Konishi et al., 2006, Hung et al., 2012) بنابراین مقایسه محتوی رونوشت در شرایط، بافت و یا زمان خاص، الگوهای اختصاصی بیان ژن در هر مرحله را تعیین میکند و تعیین وظایف ژنها را تسهیل میکند
.(Weiberg & Karlovsky, 2009) ترنسکریپتومیکس در یک بافت، زمان و یا شرایط خاص، عنصری کلیدی در ژنومیکس کارکردی است که درک ما را از نحوه کارکرد ژنها افزایش میدهد.(Weiberg & Karlovsky, 2009) بنابراین مطالعه تنظیم بیان ژنها، شناخت کارکرد آنها و مکانیسمهای مولکولی تنظیمی سامانههای زیستی را بهبود میدهد.
QPCR برای مطالعه خصوصیتهای متنوع ژنتیکی اختصاصی موثر در تنظیم بیان ژن در اکثر جانداران استفاده شده است .(Amini et al., 2017) این مطالعات دیدگاه عمیق و منطقی در زمینه اساس ژنتیکی تنوع طبیعی در سطح mRNA ایجاد کرده و نقش بیان ژنها در ایجاد تنوع فنوتیپی را بررسی کرده است. همچون متابولیتهای اولیه، متابولیتهای حد واسط نیز در سازگاری در پاسخ به تغییرات محیطی موثرند .(Kliebenstein & Osbourn, 2012, Moore et al., 2014) بهنظر میرسد کاداوارین، متابولیتی است که در پاسخ به تنش محتوی آن افزایش مییابد .(Alcazar & Tiburcio, 2018)تنظیم بیان ژنها نقش کلیدی در سنتز متابولیتها دارد و در ادامه حیات موجودات تحت تنشهای محیطی نقش موثری ایفا میکند. این ارتباط بدون ایجاد ناهماهنگی در تنظیم بیان ژنهایی که در سنتز متابولیتهای اختصاصی نقش دارند، انعطاف مناسبی در گیاهان برای سازش به تغییرات محیطی فراهم میکند. پژوهشها در زمینه بیان ژنها نقش تنظیم بیان ژنها را در ایجاد تنوع بین ژنوتیپهای حساس و متحمل و بهبود تحمل سرما از طریق ایجاد تنوع در متابولیتهای اختصاصی را نشان دادهاند ((Karami Moalem et al., 2018.
هدف این پژوهش بررسی پاسخهای متابولیکی و مولکولی سازگاری به تنش سرما در دو ژنوتیپ حساس (ILC533) و متحمل (Sel96th11439) نخود کابلی (C. arietinum L.) است. در این راستا تغییرات محتوی کاداوارین توسط فعالیت عوامل موثر در این مسیر متابولیک یعنی بیان ژن DAO و فعالیت آنزیم DAO بهعنوان بخشی از فعالیت دفاعی چندگانه سلول در برابر تنش سرما بهمنظور بهبود محتوی این متابولیت سلولی در جهت بهبود پاسخهای متمایز زودهنگام و دیرهنگام ژنوتیپهای حساس و متحمل نخود به تنش سرما همراه با H2O2 بهعنوان شاخص آسیب سلولی بررسی خواهد شد. شناسایی نحوه تنظیم القایی برخی مسیرهای متابولیسمی پاسخ به تنش از جمله کاداوارین که بیانگر نتایج احتمالی این پژوهش است، امکان دارد تغییرات محتوی این مولکول و مسیرهای تنظیمی آن را بهعنوان نشانگرهای آگاهیبخش متابولیکی بهمنظور شناسایی ژنوتیپهای متحمل به سرمای نخود پیشنهاد و همچنین منجر به بکارگیری آنها در راستای هدف بهنژادی صفت تحمل تنش سرما از طریق بهبود تحمل و یا افزایش بقا گیاه در راستای اهداف برنامههای کشاورزی پایدار شود. همچنین بررسی ارتباط احتمالی بین منابع ایجاد آسیب تنش و عوامل دفاعی سلول به درک بهتر نحوه بهبود تحمل به تنش سرما در نخود زراعی منجر خواهد شد.
در این پژوهش از بذر دو ژنوتیپ نخود کابلی (C. arietinum L.) متحمل به سرما) (Sel96th11439) با منشا ایکاردا و حاصل از تلاقی ژنوتیپهای (ILC482×ILWC182) و حساس به سرما (ILC533) منشا گرفته از ارقام بومی مصر استفاده شد. بذور از بانک ژن گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران (کرج) تهیه شدند
al., 2011; Saeed et al., 2011) .(Heidarvand et بذور با هیپوکلریت سدیم 10 درصد بهمدت 10 دقیقه ضدعفونی شده و پس از شستشو با آب مقطر روی کاغذ صافی در پتریدیش با رطوبت لازم قرار گرفتند. پتریدیشها در شرایط بدون نور و دمای بیست و سه درجه سانتیگراد بهمدت سه شبانهروز قرار گرفتند و پس از جوانهزنی، گیاهچهها به گلدانهای سایز 12 (با قطر دهانه دوازده سانتیمتر و ارتفاع ده سانتیمتر حاوی رس، ماسه و کود دامی به نسبت سه به یک به 25/0 حجمی) انتقال یافتند. گلدانها در اتاقک رشد آزمایشگاه گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه تهران در سال 1396 با نور دویست میکرومول بر متر مربع بر ثانیه (حدود 10000 لوکس) و شرایط نوری 16 ساعت روز و هشت ساعت شب و دمای بیست و سه درجه سانتیگراد و رطوبت نسبی هفتاد و پنج درصد قرار داده شدند. جهت بررسی پاسخهای گیاهی به تنش سرما، در روز بیست و یکم گیاهچهها (با ارتفاع حدود بیست سانتیمتر و دارای حداقل پنج شاخه به طول پنج تا هشت سانتیمتر) به اتاقک رشد (آروین تجهیز، اسپادانا، ایران) با دمای ˚C4 بهعنوان دمای [5]LT50 نخود (et al., 2005; Kazemi-Shahandashti et al., 2013 (Nayyar منتقل شدند و نمونهگیری از برگهای میانی هر گیاهچه بهعنوان برگهای فعال از دیدگاه فیزیولوژیکی در روز اول پس از شروع تنش سرما (جهت بررسی پاسخهای زودهنگام) و روز ششم پس از شروع تنش (جهت بررسی پاسخهای دیرهنگام گیاه) انجام شد .(Rakei et al., 2016)
نمونهگیری از گیاهچهها در اتاقک رشد با دمای بیست و سه درجه سانتیگراد نیز بهعنوان گیاهان شاهد انجام گرفت (سن فیزیولوژیک تمام گیاهان یکسان درنظر گرفته شدHurry & Huner, 1991; Kazemi-Shahandashti et al., 2014) ). بنابراین در این پژوهش اثر سه نوع تیمار دمایی (شامل گیاهچهها در دمای 23 درجه سانتیگراد، گیاهچهها یک روز و شش روز پس از شروع تنش سرما) در دو ژنوتیپ متحمل و حساس بهصورت آزمایش فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی و با سه تکرار بررسی شد.
مقدار 350 میلیگرم نمونه تازه برگی با نیتروژن مایع در هاون چینی به پودر تبدیل شد. پودر تهیهشده به فالکون 15 میلیلیتری انتقال یافت و سپس 5 میلیلیتر محلول تریکلرواستیکاسید یک درصد (محلول در حمام یخ) به تیوب اضافه شد و تیوبها تا یکنواختشدن نمونهها در حمام یخ قرار داده شد. تیوب حاوی نمونه یکنواختشده بهمدت 15 دقیقه و در دمای˚C 4 با سرعت
× g 12000 سانتریفیوژ شد. سپس500 میکرولیتر از مایع رویی به یک تیوب جدید حاوی یک میلیلیتر محلول یک مولار یدید پتاسیم و 5/0 میلیلیتر بافر فسفات 10 میلیمولار افزوده شد و پس از چندبار وارونهکردن تیوب در محیط تاریک برای یکنواختکردن محتوی آن، مقدار جذب هر نمونه در طول موجnm 390 توسط دستگاه اسپکتروفوتومتر
(Shimadzu UV-160, Kyoto, Japan) اندازهگیری شد .(Loreto & Velikova, 2001) نتایج بهصورت میکرومول در هر گرم وزن تر گیاه بیان شد.
سنجش کمی Cad بهروش(1987) Walter & Geunانجام شد. 250 میلیگرم از بافت گیاهی در دو میلیلیتر محلول پرکلریکاسید ([6]PCA) چهار درصد حاوی 1و 7 دیآمینوهپتان) [7]پنج میلیگرم در لیتر از اسیدکلریدریک دو نرمال( هموژنیزه شد. پس از یک ساعت قرارگیری درC ˚4، از فیلتر) پالایشگر( 45 درصد میکرونی عبور داده شد. روی 2/0 میلیلیتر از این محلول، یک میلیلیتر بافر کربنات با 9 pH و یک میلیلیتر محلول دانسیلکلراید) [8]10میلیگرم در یک میلیلیتر استون( اضافه و مخلوط شد. پس از اضافهکردن 50 میکرولیتر محلول پرولین (100 میلیگرم در لیتر) دانسیلکلراید اضافی حذف شد و سپس 400 میکرولیتر تولوئن به آن اضافه و بهمدت 30 ثانیه ورتکس شد و پس از سانتریفوژ × g 500 بهمدت دو دقیقه فاز آلی (رویی) برداشته و این محلول برای ارزیابی Cad توسط HPLC استفاده شد. بهمنظور ارزیابی کمی Cad 10 میکرولیتر از محلول پایانی به ستون
Chrompack-Nederland در دستگاه HPLC مدل Unickam-crystal 200 تزریق شد. دتکتور این دستگاه از نوع UV است که در طول موج 337 نانومتر تنظیم شد. از نمونههای استاندارد برای تعیین وجود Cad و غلظتسنجی آن استفاده شد.
بر اساس روش López-Gómez et al. (2014)، پس از پودرکردن 4/0 گرم بافت برگی در 2/1 میلیلیتر بافر استخراج (بافر سدیمفسفات 100 میلیمولار با 5/6pH ) نمونهها سانتریفوژ (C˚4،min 20،× g 10000( و مایع رویی برداشته شد. واکنش سنجش فعالیت آنزیم DAO حاوی 630 میکرولیتر بافر سدیمفسفات 100 میلیمولار با 5/6pH ، 70 میکرولیتر محلول واکنش
) 25/6 میکرولیتر اناندیمتیلآنیلن[9]، 5/2 میلیگرم 4-آمینوآنتیپرین[10]، 25 میلیلیتر بافر سدیمفسفات 100 میلیمولار با
5/6 pH)، 100 میکرولیتر پراکسیداز (42/1 میلیگرم در هر میلیلیتر بافر سدیمفسفات 100 میلیمولار با 5/6pH )، 100 میکرولیتر نمونه برگی و 100 میکرولیتر cad (2/3 میلیگرم در هر میلیلیتر بافر سدیمفسفات 100 میلیمولار با 5/6pH ) بود. میزان فعالیت این آنزیم در طول موج 550 نانومتر توسط دستگاه اسپکتروفتومتر اندازهگیری شد.
1-3. استخراج RNA، سنتز cDNA و واکنشQuantitative Reverse-Transcriptase PCR (QRT-PCR)
استخراجRNA کل سلول بهروش ترایزول با 80 میلیگرم نمونههای بافت برگی خردشده بهکمک ازت مایع در هاون چینی استریل انجام گرفت. کیفیت RNA استخراجشده توسط الکتروفورز روی ژل آگارز یک درصد تعیین شد (شکل 2). تشکیل دو باندRNA ریبوزومی S18و S25 روی ژل کیفیت بالای RNA تخلیصشده را تایید کرد. برای بررسی کمی میزان غلظت RNA از دستگاه نانودراپ (Thermo Scientific model 1000) در طول موج nm 260 استفاده شد. در مرحله بعد RNA استخراجشده با آنزیم DNaseІ براساس روش پیشنهادی شرکت فرمنتاز تیمار شد. دو میکروگرم RNA، یک میکرولیتر بافر، یک واحد (u) آنزیم DNaseІ و 10 واحد (u) آنزیمRNase inhibitor ، مخلوط و با افزودن آبDEPC حجم محلول به 10 میکرولیتر رسانده شد و بهمدت 30 دقیقه در دمای˚C 37 قرار گرفتند. سپس یک میکرولیتر EDTA به تیوبها اضافه شد و بهمدت 10 دقیقه در دمای
˚C 65 قرار داده شدند. تیوبها در˚C 80- نگهداری شدند. بهمنظور ساخت cDNA، پنج میکرولیتر RNA تیمارشده با DNaseI با کمک آغازگر الیگودیتی (یک پیکومول) (20-18 نوکلئوتید) مخلوط شد و حجم محلول با استفاده از آب DEPC به 11 میکرولیتر رسانده شد. این مخلوط بهمدت پنج دقیقه در دمای˚C 70 قرار گرفت و پس از آن روی یخ سرد شد. سپس چهار میکرولیتر بافر واکنش و دو میکرولیتر دیاکسینوکلئوتریفسفات (dNTPs) با غلظت 10 میکرومول و 20 واحد آنزیم RNase inhibitorبه هر تیوب اضافه شد و حجم محلول با آب DEPC به 19 میکرولیتر رسانده شد و بهمدت پنج دقیقه در دمای˚C37 قرار داده شد. بعد از آن 200 واحد (u) آنزیم Revert Aid M-Mulv به این محلول افزوده شده و پس از مخلوطکردن بهمدت یک ساعت در دمای˚C 42 قرار دادهشد. سپس برای غیر فعالکردن واکنش، تیوبها بهمدت 10 دقیقه در دمای˚C 70 قرار گرفتند. بهمنظور تایید سنتز cDNA از روش تکثیر ژن خانهدار اکتین1 (Actin1) استفاده شد، بهطوریکه پس از رقیقسازی و رساندن غلظت cDNA سنتزشده به 200 نانوگرم در میکرولیتر واکنش PCRو الکتروفورز قطعه تکثیرشده روی ژل آگارز یک درصد انجام شد
(Peng et al., 2010) . نتایج حاکی از مطابقت اندازه باند مشاهدهشده با اندازه ژن خانهدار bp)189) بود. مقدار 20 میکرولیتر مخلوط واکنش شامل 10 میکرولیتر کیت حاوی رنگ فلورسنت Evagreen، سه میکرولیتر آب مقطر استریل، یک میکرولیتر از هر یک از آغازگرهای اختصاصی مستقیم و معکوس با غلظت 10 میکرومول و پنج میکرولیتر نمونه cDNAسنتزشده با غلظت 200 نانوگرم در میکرولیتر (رقیقشده با نسبت 1:20) بررسی شد. پس از آمادهکردن مخلوط واکنش، پلیت موردنظر به دستگاه iQ5 منتقل شد و واکنش زنجیرهای پلیمراز به این صورت انجام گرفت: دو دقیقه در دمای ˚C94 و 35 تکرار با چرخههای 10 ثانیه در دمای˚C 95، 10 ثانیه در دمای˚C 57 Tm آغازگر و 10 ثانیه در دمای ˚C72. تایید اختصاصیبودن قطعات تکثیرشده بااستفادهاز تجزیه و تحلیل منحنی ذوب انجام شد. منحنی ذوب با خنکشدن تا دمای ˚C55 با سرعت˚C 20 در ثانیه ثبت شد، سپس در دمای ˚C 55 بهمدت 30 ثانیه ثابت ماند و سپس با گرمایش آهسته با سرعت˚C 5/0 در ثانیه تا دمای ˚C95 افزایش یافت. فلورسانس بهطور مداوم در طول دوره افزایش آهسته دما برای نظارت بر تفکیک رنگ Evagreen اندازهگیری شد.
ترسیم سیگنالهای فلورسانس بهطور خودکار در زمان واقعی و در مقابل دما برای ایجاد منحنیهای ذوب انجام گرفت. بر اساس منحنیهای استاندارد رسمشده حاصل از پنج سریال رقت (1، 1:10، 1:20، 1:50 و 1:100) کارایی PCR در تمام آغازگرها در حدود 9/1 تا 2 بود و شیب خط رگرسیون بین 23/3- و 42/3- بود Pfaffl, 2001)). نسبت بیان نسبی هر توالی باتوجهبه شاخص Cq محاسبهشده که میانگین کارآیی PCR ژنهای خانهدار مورد نظر در Plate را در بر میگیرد. باتوجهبه نتایج منحنیهای استاندارد، از نرمافزار REST میتوان برای محاسبه نسبت بین میزان ژن هدف و ژن خانهدار (Actin1) در هر نمونه مشخص با روش-ΔΔCT 2 بهعنوان بیان نسبی آن ژن استفاده کرد .(Livak & Schmittgen, 2001) در این روش بیان ژن مورد نظر با بیان Actin1 که یک ژن خانهدار تنظیم شده است نرمال شده و سپس از مقادیر نرمالشده برای مقایسه بیان متفاوت ژنها در نمونههای مختلف استفاده شد. طراحی آغازگر برای ژن اختصاصی DAO و ژن خانهدار Actin1بااستفادهاز تارنمای
Integrated DNA Technologies, Inc. (IDT)به آدرس (https://www.idtdna.com)برای دستیابی به آغازگرهای دارای خصوصیات مناسب انجام گرفت. در جدول 1 نام آغازگرهای ژنهای اختصاصی و خانهدار، توالی و شماره دسترسی آنها ارائه شده است.
شکل 2. نگاره نوارهای RNA استخراجشده. از چپ به راست بهترتیب: 1) نشانگر اندازه با نوارهای مشخصشده ، 2 و 3) ژنوتیپ متحمل و حساس شاهد، 4 و 5) ژنوتیپ متحمل و حساس روز اول تنش سرما.
جدول 1. توالیهای آغازگر استفادهشده در واکنش زنجیرهای پلیمراز در زمان واقعی.(QPCR)
Amplicon length (bp) |
Tm (˚C) |
Sequence (5´-3´) |
Protein name |
Gene name |
Accession number |
101 |
57 |
F: CTGTGCCTACTGCTGAGAAA R:TGAACCTTGTGGTTGATGACTA |
Diamine oxidase |
DAO |
AJ009825 |
189 |
57 |
F: CTACGAATTGCCTGATGGAC R: CCTCCTGAAAGGACGATGTT |
Actin1 |
Act1 |
EU529707.1 |
تفاوت معنیداری بین تیمارهای آزمایشی از نظر میزان H2O2، کاداوارین، فعالیت آنزیم DAO و بیان ژن DAO (01/0P<) وجود داشت (جدول 2). میزان تجمع H2O2 که از مهمترین شاخصهای تنش اکسیداتیو در سلول میباشد
(Kazemi Shahandashti & Maali Amiri, 2018)، تحت تنش سرما در ژنوتیپ حساس در مقایسه با ژنوتیپ متحمل بیشتر بود (حداکثر بیش از 69% در روز ششم تنش). در ژنوتیپ متحمل میزان H2O2 پس از افزایش معنیدار در روز اول تنش، در روز ششم کاهش یافته، بهطوریکه تجمع آن در مقایسه با شرایط شاهد بهطور معنیداری کمتر شد (بیش از 7/4%)، درحالیکه تجمع آن در ژنوتیپ حساس در مقایسه با شرایط شاهد بهطور پیوسته افزایش یافت (تا 50%) (شکل 3-الف). بنابراین درجه تحمل به تنش سرما در دو ژنوتیپ نخود با یکدیگر متفاوت بوده؛ بهطوریکه این نتایج بیانگر ارتباط احتمالی تاثیر پاسخهای دفاعی ژنوتیپهای نخود میباشد. همچنین حداقل میزان H2O2 در روز ششم تنش سرما در گیاهان متحمل مشاهده شده (شکل 3-الف) که بیانگر فرآیند سرما سازگاری نسبی است. چنین فرآیندهایی احتمالا از برنامهریزی مجدد ژنوم و هموستازی متابولیکی منشا میگیرد (Heidarvand & Maali Amiri, 2010). بنابراین سنجش شاخص H2O2 میتواند بهعنوان یک نشانگر تحمل سرما در نخود بهکار رود.
در گیاهان بخشی از سازگاری به تنش در اثر تنظیم میزان کاداوارین از طریق مسیر بیوسنتزی آن و یا فعالیت مسیر تخریب کاداوارین ایجاد میشود (Su & Bai, 2008). نتایج نشان داد که در شرایط شاهد میزان متابولیتها و فعالیت آنزیم اندازهگیریشده در ژنوتیپ متحمل بیشتر از ژنوتیپ حساس بود (شکل 3-ب و ج). تحت تنش سرما میزان کاداوارین، فعالیت آنزیم DAO و بیان ژن DAO در هر دو ژنوتیپ افزایش یافت؛ بهطوریکه این افزایش در ژنوتیپ متحمل در مقایسه با ژنوتیپ حساس معنیدار بود، چنین نتایجی بیانگر پاسخهای ژنتیکی مطلوب ژنوتیپ متحمل در جهت حفظ محتوی کاداوارین برای مقابله با آثار مخرب ROS سلولی است (شکل 3-الف-د).
جدول 2. تجزیه واریانس صفات مورد مطالعه در دو ژنوتیپ حساس و متحمل به سرما نخود زراعی در سطوح مختلف تنش سرما.
S.O.V. |
df |
M.S. |
|||
H2O2 |
Cad |
DAO |
DAO |
||
Genotype |
1 |
**64/3327 |
**162 |
**80/1 |
**65/1 |
Temprature |
2 |
**98/748 |
**162 |
**05/3 |
**54/4 |
Genotype× Temprature |
2 |
**88/664 |
**162 |
**56/0 |
**86/0 |
Error |
12 |
1 |
66/0 |
06/0 |
012/0 |
(%)C.V. |
|
1/1 |
2/27 |
70/17 |
91/5 |
نتایج نشان داد که محتوی Cad تنها در ژنوتیپ متحمل در روز ششم پس از تنش سرما بهمیزان 18 نانومول بر گرم در وزن تر بود و این متابولیت در بقیه تیمارهای سرمایی و همچنین شرایط شاهد در هر دو ژنوتیپ وجود نداشت (شکل 3-ب). در امتداد با دادههای پیشین در گیاهان زراعی، این نتایج به نقش القایی این متابولیت تحت تنش اشاره دارد (Kuznetsov et al., 2007; Sziderics et al., 2010; Simon-Sarkadi, 2014).
شکل 3. تغییر میزان H2O2 (الف)، کاداوارین (ب)، فعالیت آنزیم دیآمیناکسیداز (DAO) (ج) و بیان ژن دیآمیناکسیداز (DAO) (د) در ژنوتیپهای متحمل Sel96Th11439 (ستون سیاه) و حساس ILC533 (ستون خاکستری) به سرمای نخود تحت تیمارهای دمایی شامل دمای طبیعی (23°C)، روز اول و روز ششم تنش سرما (°C4). حروف متفاوت نشاندهنده اختلاف معنیدار بین میانگینها براساس مقایسه میانگین دانکن.
یافتهها نشان داده که اسپریپاشی کاداوارین (یک میلیمولار) روی برگ و بذور گیاهان آثار نامطلوب تنش شوری و فلزات سنگین را از طریق افزایش رنگیزههای فتوسنتزی، فعالیت نیتراتردوکتاز، نیتروژن آلی، پروتئین محلول، رشد گیاهچه و حذف آثار نامطلوب رادیکالهای آزاد اکسیژن افزایش داده است (Aziz et al., 1997; 1999; Cavusoglu et al., 2007;
Sziderics et al., 2010; Tomar et al., 2013a; Tomar et al., 2013b). براساس همخوانی نتایج این پژوهش با دادههای گذشته بهنظر میرسد در نخود زراعی ارتباط معنیداری بین ظهور کاداوارین و محتوی کاهشیافته شاخصهای خسارت سرما (از جمله نتایج H2O2) وجود داشته که بیانگر تاثیر آن در بهبود پایداری غشای سلولی تحت تنش سرما میباشد نتایجی که نیاز به پژوهشهای عمیقتری در این زمینه دارد (Kim et al., 2002). افزایش نسبی میزان H2O2 در پاسخهای زودهنگام در ژنوتیپ متحمل و کاهش معنیدار آن در روز ششم تنش سرما (شکل 3-الف) از یک طرف بیانگر نقش پیامرسانی H2O2 در القا پاسخهای دفاعی سلولهای گیاهی و از طرف دیگر در امتداد با افزایش میزان کاداوارین، ارتباط معنیدار آنها را نشان میدهد.
عدم وجود Cad در پاسخهای زودهنگام و دیرهنگام ژنوتیپ حساس و پاسخهای زودهنگام ژنوتیپ متحمل احتمالا میتواند بهدلیل ضعف سامانههای دفاعی در ژنوتیپ حساس و یا افزایش محتوی سایر متابولیتهای سازگارساز موثر در بهبود تحمل سرما در ژنوتیپ متحمل باشد (Rakei et al., 2016). اگرچه نتایج هیچ همبستگی معنیدار مستقیمی بین محتوی Cad با شاخصهای خسارت سلولی نشان نداد، اما وجود رابطه منفی بین آنها بیانگر نقش حفاظتی این پلیآمین در بهبود تحمل به تنش سرما در گیاه نخود بوده که با نتایج تحقیقات پیشین در خصوص اتصال کاداوارین به رادیکالهای آزاد اکسیژن و خنثی سازی آثار مضر آنها بر اجزای مختلف سلول و تعدیل آثار تنش مطابقت دارد (Cavusoglu et al., 2007; Tomar et al., 2013b).
بر خلاف الگوی تغییر Cad تحت تنش سرما، فعالیت آنزیم DAOکه آنزیمی است که در تجزیه کاداوارین موثر است، در ژنوتیپ متحمل و حساس در مقایسه با شاهد بهطور تدریجی افزایش یافت (حداکثر تا بیش از سه برابر) و در روز ششم تنش سرما در ژنوتیپ متحمل به بالاترین میزان رسید (شکل 3-ج). این نتایج بیانگر نقش این آنزیم در تجزیه سایر پلیآمینها از جمله پوتریسین است (Amini et al., 2021). مشابهبا نتایج این آزمایش، در بذر برنج نیز تحت تنش سرما فعالیت آنزیم DAO روند افزایشی نشان داد Sheteiwy et al., 2017)). اگرچه در ژنوتیپ حساس نیز فعالیت DAO تحت تنش سرما در مقایسه با شاهد روند افزایشی داشت (حداکثر تا 5/2 برابر)، اما این روند صعودی در ژنوتیپ حساس در مقایسه با ژنوتیپ متحمل نرخ کندتری داشت (شکل 3-ج) که بیانگر فعالیت کمتر این آنزیم در ژنوتیپ حساس بهدلیل عدم بیوسنتز دیآمین کاداوارین (شکل 3-ب) و همچنین بیوسنتز کمتر سایر دیآمینها از جمله پوتریسین (Amini et al., 2021) و در نتیجه نیاز کمتر به فعالیت این آنزیم است.
بر اساس نتایج، الگوی تغییر میزان H2O2 (شاخص خسارت) بهعنوان محصول جانبی فعالیت آنزیم DAO ( شاخص دفاع) در شرایط شاهد و تحت تنش سرما متفاوت با الگوی فعالیت DAO بوده که احتمالا بهدلیل کارایی مطلوب فعالیت سامانه آنتیاکسیدانی ژنوتیپ متحمل در جهت حذف ROS میباشد (Heidarvand & Maali-Amiri, 2013). پژوهش
((Duan et al., 2008 نشان داد که تحت تنش شوری همزمان با افزایش میزان پلیآمینها، فعالیت آنزیم DAO نیز افزایش یافته و میزان تجمع پلیآمینها با فعالیت آنزیم DAO در ارتباط است. بنابراین بهنظر میرسد که فعالیت DAO تحت تنش سرما وابستهبه غلظت کاداوارین و پوتریسین بوده که در هر دو ژنوتیپ، بهمنظور پاسخ آسیبهای سلولی (نتایج H2O2) میشود، اگرچه در ژنوتیپ متحمل بهدلیل تجمع بیشتر کاداوارین با فعالیت شدیدتر آنزیم DAO کاهش H2O2 شدیدتر خواهد بود. پژوهشها نشان داده که در گوجهفرنگی سازگار شده به سرما فعالیت DAO در رقم متحمل بطور چشمگیری در مقایسه با حساس افزایش یافت (Song et al., 2015). بنابراین افزایش معنیدار فعالیت آنزیم تجزیهکننده دیآمینهای کاداوارین و پوتریسین از طریق کاراترکردن مسیرهای متابولیکی پاسخ به سرما میتواند در بهبود تحمل گیاه به تنشهای غیر زیستی از جمله سرما ایفای نقش کند (Shelp et al., 2012a). تحت تنشهای محیطی کاتابولیسم دیآمینها علاوهبر ایفای نقش در سازوکارهای دفاعی، در بسیاری از فرآیندهای رشد و نموی و پیامرسانی سلولی نیز مشارکت دارد (Tavladoraki et al., 2012). همچنین اگرچه مسیر بیوسنتز PAs نقش مهمی در تنظیم میزان این متابولیتها دارد، مسیر تجزیه آنها نیز از یک سو بهدلیل ارتباط با مسیرهای متابولیسمی مختلف از جمله برخی آلکالوئیدها و از سوی دیگر تولید مولکولهای پیامرسان از جمله H2O2در هموستازی آنها موثر خواهد بود (Moschou et al., 2012). بنابراین نتایج این پژوهش، الگوی متمایز فعالیت آنزیم DAO در پاسخهای زودهنگام و دیرهنگام به سرما و همچنین ژنوتیپهای حساس و متحمل نخود زراعی را نشان داده، بهطوریکه مطالعه فعالیت این آنزیم بهعنوان عامل موثر در مسیر تجزیه دیمین کاداواین در شرایط آزمایش تاییدکننده تمایز آشکاری در تجمع این متابولیت بهعنوان یکی از شاخصهای تحمل به سرما در برابر عوامل آسیبهای سلولی (نتایج H2O2) در نخود در نظر گرفته میشود
ژن DAO (CuAO) رمز کننده آنزیم DAO بوده و نقش مهمی در تنظیم شبکه متابولیک پاسخ به تنشهای محیطی دارد (Wimalasekera et al., 2011b). بهمنظور دستیابی به فرایند مولکولی چگونگی تغییر فعالیت این آنزیم در پاسخ به تنش سرما، بیان نسبی ژن DAO بررسی شد. نتایج نشان داد که میزان بیان نسبی توالی رمزکننده آنزیم DAO در هر دو ژنوتیپ حساس و متحمل تحت تنش سرما در مقایسه با شاهد به طور پیوسته افزایش یافت (تقریبا حداکثر تا بیش از 3/3 برابر) (شکل 3-د) که حاکی از موثرتر بودن این مسیر در ژنوتیپ متحمل در مقایسه با ژنوتیپ حساس در جهت القا تحمل به سرما بود. در روز اول و همچنین روز ششم تنش سرما میزان بیان این ژن در ژنوتیپ متحمل بهطور معنیداری بیشتر از ژنوتیپ حساس بود (حداکثر تا بیش از 7/1 برابر در روز ششم پس از تنش سرما) (شکل 3-د). بیان این ژن در ژنوتیپ متحمل در روز اول و ششم تنش سرما در مقایسه با شاهد بهترتیب بیش از 2/2 و 5/3 برابر افزایش یافت (شکل 3-د). این نتایج بیانگر القا موثرتر فعالیت ژنوم در سطح رونویسی بهمنظور آمادهسازى گیاه براى رویارویى با دماهاى پایینتر بهموازات بروز کمترین خسارت میباشد، مشاهداتی که توسط نتایج شاخص آسیب سلولی نیز تایید شد. افزایش میزان رونوشتها به موازات افزایش فعالیت آنزیم DAO اشاره به تنظیم این مسیر بیوشیمیایی هم در سطح رونویسی و هم ترجمه دارد که بایستی با جزئیات بیشتر بررسی شود. این یافتهها با نتایج
(Tanou et al. (2014 که گزارش کردند که تحت تنش شوری بیان نسبی ژنهای مسیر تجزیه PAs در نارنج
(Citrus aurantium L.) افزایش یافته، هماهنگ بود. همچنین موتاسیون در ژن CuAo سبب حساسیت آرابیدوپسیس به تنش اسمزی شد (Wimalasekera et al., 2011b). بنابراین باتوجهبه نتایج بهدستآمده، القای بیان این ژن در گیاهان متحمل در اثر برنامهریزی مجدد بیان ژنها و هوموستازی سلولی نقش موثری در ایجاد الگوی پاسخهای سازگاری به تنش سرما ایفا میکند.
ارتباط شاخص آسیب سلولی (H2O2) و میزان متابولیت دیآمین کاداوارین در این آزمایش ناهمسو بود، بهطوریکه تجمع این متابولیت در ژنوتیپ متحمل به موازات فعالیت آنزیم DAO و بیان ژن DAO با کاهش آسیب سلولی در ارتباط بود. بهمنظور بهبود تحمل تنش سرما در نخود، محتوای کاداوارین توسط تنظیم دقیق فعالیت عوامل مختلف موثر در تنظیم این متابولیت، افزایش مییابد. پاسخهای متمایز زودهنگام و دیرهنگام ژنوتیپها به تنش سرما بیانگر راهبرد چندگانه دفاعی سلولی نخود به تنش سرما است. این یافته که گیاه نخود دارای تجمع بیشتر کاداوارین بهعنوان اسموپروتکتنت سلولی با کاهش میزان آسیبهای سلولی تحمل بیشتری به تنش سرما دارد، ممکن است به قابلیت این گیاه برای بقا و یا بهبود آن طی تنش سرما بیانجامد و کاربرد جدیدی برای اسپریپاشی کاداوارین در برنامههای کشاورزی پایدار پیشنهاد کند. با انجام مطالعات تکمیلی در ژنوتیپهای نخود بهنظر میرسد کاربرد کاداوارین در جهت بهبود تحمل به تنش سرما در برنامههای کشاورزی پایدار نخود استفاده شود. بهنظر میرسد این فرایندها غالباً همراهبا القای سامانههای دفاعی خواهد بود. باتوجهبه چالشهای زیستمحیطی، ضروری است آثار کاربرد اسپریپاشی کاداوارین، بر عملکرد و کیفیت نخود بهطور جامع مطالعه شود.
Alcázar, R., Altabella, T., Marco, F., Bortolotti, C., Reymond, M., Koncz, C., & Tiburcio, A.F. (2010a). Polyamines: Molecules with regulatory functions in plant abiotic stress tolerance. Planta, 231(6), 1237-1249.
Alcázar, R., & Tiburcio, A.F. (Eds.). (2018). Polyamines: Methods and Protocols. Humana Press.
Amini, S., Maali-Amiri, R., Kazemi-Shahandashti, S.S., Lopez-Gomez, M., Sadeghzadeh, B., Sobhani-Najafabadi, A., & Kariman, K. (2021). Effect of cold stress on polyamine metabolism and antioxidant responses in chickpea. Journal of Plant Physiology, 258, 153387.
Angelini, R., Cona, A., Federico, R., Fincato, P., Tavladoraki, P., & Tisi, A. (2010). Plant amine oxidases “on the move”: An update. Plant Physiology and Biochemistry, 48(7), 560-564.
Aziz, A., Martin-Tanguy, J., & Larher, F. (1997). Plasticity of polyamine metabolism associated with high osmotic stress in rape leaf discs and with ethylene treatment. Plant Growth Regulation, 21, 153-163.
Aziz, A., Martin-Tanguy, J., & Larher, F. (1999). Salt stress-induced proline accumulation and changes in tyramine and polyamine levels are linked to ionic adjustment in tomato leaf discs. Plant Science, 145(2), 83-91.
Carrizo, C.N., Pitta-Alvarez, S.I., Kogan, M.J., Giulietti, A.M., & Tomaro, M.L. (2001). Occurrence of cadaverine in hairy roots of Brugmansia candida. Phytochemistry, 57(5), 759-763.
Cassan, F., Maiale, S., Masciarelli, O., Vidal, A., Luna, V., & Ruiz, O. (2009). Cadaverine production by Azospirillum brasilense and its possible role in plant growth promotion and osmotic stress mitigation. European Journal of Soil Biology, 45(1), 12-19.
Çavuşoğlu, K., Kılıç, S., & Kabar, K. (2007). Some morphological and anatomical observations during alleviation of salinity (NaCI) stress on seed germination and seedling growth of barley by polyamines. Acta Physiologiae Plantarum, 29, 551-557.
Cona, A., Rea, G., Angelini, R., Federico, R., & Tavladoraki, P. (2006). Functions of amine oxidases in plant development and defence. Trends in Plant Science, 11, 80-88.
Dickinson, D.A., & Forman, H.J. (2002). Cellular glutathione and thiols metabolism. Biochemical Pharmacology, 64(5-6), 1019-1026.
Duan, J., Li, J., Guo, S., & Kang, Y. (2008). Exogenous spermidine affects polyamine metabolism in salinity-stressed Cucumis sativus roots and enhances short-term salinity tolerance. Journal of Plant Physiology, 165, 1620–1635.
Garcia-Garcia, P., Brenes-Balbuena, M., Hornero-Méndez, D., Garcia-Borrego, A., & Garrido-Fernández, A. (2000). Content of biogenic amines in table olives. Journal of Food Protection, 63(1), 111-116.
Groppa, M.D., & Benavides, M.P. (2008). Polyamines and abiotic stress: Recent advances. Amino Acids, 34, 35-45.
Heidarvand, L., & Amiri, R.M. (2010). What happens in plant molecular responses to cold stress? Acta Physiologia Plantarum, 32(3), 419-431.
Heidarvand, L., & Maali-Amiri, R. (2013). Physio-biochemical and proteome analysis of chickpea in early phases of cold stress. Journal of Plant Physiology, 170(5), 459-469.
Hung, H.Y., Shannon, L.M., Tian, F., Bradbury, P.J., Chen, C., Flint-Garcia, S.A., & Holland, J.B. (2012). ZmCCT and the genetic basis of day-length adaptation underlying the post domestication spread of maize. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(28), E1913-E1921.
Hurry, V.M., & Huner, N.P. (1991). Low growth temperature effects a differential inhibition of photosynthesis in spring and winter wheat. Plant Physiology, 96(2), 491-497.
Janmohammadi, M., Abbasi, A., & Sabaghnia, N. (2012). Influence of NaCl treatments on growth and biochemical parameters of castor bean (Ricinus communis L.). Acta Agriculturae Slovenica, 99(1), 31.
Kapoor, R.T. (2023). Role of polyamines in plants under abiotic stresses: Regulation of biochemical interactions. Plant Stress Mitigators, 209-220.
Karami-Moalem, S., Maali-Amiri, R., & Kazemi-Shahandashti, S.S. (2018). Effect of cold stress on oxidative damage and mitochondrial respiratory properties in chickpea. Plant Physiology and Biochemistry, 122, 31-39.
Kazemi Shahandashti, S.S., Maali Amiri, R., Zeinali, H., & Ramezanpour, S.S. (2013). Change in membrane fatty acid compositions and cold-induced responses in chickpea. Molecular Biology Reports, 40(2), 893-903.
Kazemi-Shahandashti, S.S., & Maali-Amiri, R. (2018). Global insights of protein responses to cold stress in plants: Signaling, defence, and degradation. Journal of Plant Physiology, 226, 123-135.
Kazemi-Shahandashti, S.S., Maali-Amiri, R., Zeinali, H., Khazaei, M., Talei, A., & Ramezanpour, S.S. (2014). Effect of short-term cold stress on oxidative damage and transcript accumulation of defense-related genes in chickpea seedlings. Journal of Plant Physiology, 171(13), 1106-1116.
Kim, T.E., Kim, S.K., Han, T.J., Lee, J.S., & Chang, S.C. (2002). ABA and polyamines act independently in primary leaves of cold-stressed tomato (Lycopersicon esculentum L.). Physiologia Plantarum, 115, 370–376.
Kliebenstein, D.J., & Osbourn, A. (2012). Making new molecules evolution of pathways for novel metabolites in plants. Current Opinion in Plant Biology, 15, 415–423.
Köhler, Z.M., & Szepesi, Á. (2023). More than a diamine oxidase inhibitor: L-aminoguanidine modulates polyamine-related abiotic stress responses of plants. Life, 13(3), 747.
Konishi, S., Izawa, T., Lin, S.Y., Ebana, K., Fukuta, Y., Sasaki, T., & Yano, M. (2006). An SNP caused loss of seed shattering during rice domestication. Science, 312, 1392–1396.
Kuznetsov, V., Shorina, M., Aronova, E., Stetsenko, L., Rakitin, V., & Shevyakova, N. (2007). NaCl-and ethylene-dependent cadaverine accumulation and its possible protective role in the adaptation of the common ice plant to salt stress. Plant Science, 172(2), 363-370.
Kuznetsov, V.V., Stetsenko, L.A., & Shevyakova, N.I. (2009). Exogenous cadaverine induces oxidative burst and reduces cadaverine conjugate content in the common ice plant. Journal of Plant Physiology, 166(1), 40-51.
Livak, K.J., & Schmittgen, T.D. (2001). Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2−ΔΔCT method. Methods, 25, 402–408.
López-Gómez, M., Hidalgo-Castellanos, J., Iribarne, C., & Lluch, C. (2014) Proline accumulation has prevalence over polyamines in nodules of Medicago sativa in symbiosis with Sinorhizobium meliloti during the initial response to salinity. Plant Soil, 374, 149-159.
López-Gómez, M., Hidalgo-Castellanos, J., Muñoz-Sánchez, J.R., Marín-Peña, A.J., Lluch, C., & Herrera-Cervera, J.A. (2017). Polyamines contribute to salinity tolerance in the symbiosis Medicago truncatula-Sinorhizobium meliloti by preventing oxidative damage. Plant Physiology and Biochemistry, 116, 9-17.
Loreto, F., & Velikova, V. (2001) Isoprene produced by leaves protects the photosynthetic apparatus against ozone damage, quenches ozone products, and reduces lipid peroxidation of cellular membranes. Plant Physiology, 127(4), 1781-1787.
Mantri, N.L., Ford, R., Coram, T.E., & Pang, E.C. (2007). Transcriptional profiling of chickpea genes differentially regulated in response to high-salinity, cold and drought. BMC Genomics, 8(1), 303.
Moore, B.D., Andrew, R.L., K€ulheim, C., & Foley, W.J. (2014). Explaining intraspecific diversity in plant secondary metabolites in an ecological context. New Phytologist, 201, 733–750.
Moschou, P.N., Wu, J., Cona, A., Tavladoraki, P., Angelini, R., & Roubelakis-Angelakis, K.A. (2012). The polyamines and their catabolic products are significant players in the turnover of nitrogenous molecules in plants. Journal of Experimental Botany, 63, 5003–5015.
Napieraj, N., Janicka, M., & Reda, M. (2023). Interactions of polyamines and phytohormones in plant response to abiotic stress. Plants, 12(5), 1159.
Nayyar, H., Satwinder, K., Kumar, S., Singh, K.J., & Dhir, K.K. (2005). Involvement of polyamines in the contrasting sensitivity of chickpea (Cicer arietinum L.) and soybean (Glycine max (L.) Merrill.) to water deficit stress. Botanical Bulletin of Academia Sinica, Sin 46.
Peng, H., Cheng, H., Yu, X. et al. (2010). Molecular analysis of an actin gene, CarACT1, from chickpea (Cicer arietinum L.). Molecular Biology Reports, 37, 1081.
Pfaffl, M.W. (2001). A new mathematical model for relative quantification in real-time RT–PCR. Nucleic Acids Research, 29(9), e45-e45.
Rajpal, C., & Tomar, P.C. (2020). Cadaverine: A diamine presence & role in plants. Plant Arch, 20, 1754-1763.
Rakei, A., Maali-Amiri, R., Zeinali, H., & Ranjbar, M. (2016). DNA methylation and physio-biochemical analysis of chickpea in response to cold stress. Protoplasma, 253(1), 61-76.
Saeed, A., Hovsepyan, H., Darvishzadeh, R., Imtiaz, M., Panguluri, S. K., & Nazaryan, R. (2011). Genetic diversity of Iranian accessions, improved lines of chickpea (Cicer arietinum L.) and their wild relatives by using simple sequence repeats. Plant Molecular Biology Reporter, 29(4), 848-858.
Samanta, I., Roy, P.C., Das, E., Mishra, S., & Chowdhary, G. (2023). Plant peroxisomal polyamine oxidase: A ubiquitous enzyme involved in abiotic stress tolerance. Plants, 12(3), 652.
Shalaby, A.R. (2000). Changes in biogenic amines in mature and germinating legume seeds and their behavior during cooking. Food/Nahrung, 44(1), 23-27.
Shelp, B.J., Bozzo, G.G., Trobacher, C.P., Zarei, A., Deyman, K.L., & Brikis, C.J. (2012a). Hypothesis/review: contribution of putrescine to 4-aminobutyrate (GABA) production in response to abiotic stress. Plant Science, 193, 130-135.
Shen, H.J., & Galston, A.W. (1985). Correlations between polyamine ratios and growth patterns in seedling roots. Plant Growth Regulation, 3(3-4), 353-363.
Sheteiwy, M., Shen, H., Xu, J., Guan, Y., Song, W., & Hu, J. (2017). Seed polyamines metabolism induced by seed priming with spermidine and 5-aminolevulinic acid for chilling tolerance improvement in rice (Oryza sativa L.) seedlings. Environmental and Experimental Botany, 137, 58-72.
Simon-Sarkadi, L., Ludidi, N., & Kocsy, G. (2014). Modification of cadaverine content by NO in salt-stressed maize. Plant Signaling & Behavior, 9, e27598.
Song, Y., Diao, Q., & Qi, H. (2015). Polyamine metabolism and biosynthetic genes expression in tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) seedlings during cold acclimation. Plant Growth Regulation, 75(1), 21-32.
Su, G.X., & Bai, X. (2008). Contribution of putrescine degradation to proline accumulation in soybean leaves under salinity. Biologia Plantarum, 52(4), 796.
Sziderics, A.H., Oufir, M., Trognitz, F., Kopecky, D., Matušíková, I., & Hausman, J.F. (2010). Organ-specific defence strategies of pepper (Capsicum annuum L.) during early phase of water deficit. Plant Cell Report, 29, 295–305.
Tanou, G., Ziogas, V., Belghazi, M., Christou, A., Filippou, P., Job, D., & Molassiotis, A. (2014). Polyamines reprogram oxidative and nitrosative status and the proteome of citrus plants exposed to salinity stress. Plant, Cell Environment, 37(4), 864-885.
Tavladoraki, P., Cona, A., Federico, R., Tempera, G., Viceconte, N., Saccoccio, S., & Agostinelli, E. (2012). Polyamine catabolism: target for antiproliferative therapies in animals and stress tolerance strategies in plants. Amino Acids, 42(2-3), 411-426.
Tomar, P.C., Lakra, N., & Mishra, S.N. (2013b). Effect of cadaverine on Brassica juncea (L.) under multiple stresses. Indian Journal of Experimental Biology, 51, 758–763.
Varshney, R.K., Song, C., Saxena, R.K., Azam, S., Yu, S., Sharpe, A.G., & Millan, T. (2013). Draft genome sequence of chickpea (Cicer arietinum L.) provides a resource for trait improvement. Nature Biotechnology, 31(3), 240.
Walter H.J.P., & Geuns J.M. (1987) High speed HPLC analysis of polyamines in plant tissues. Plant Physiology, 83, 232-234.
Wang, X., Chen, Q., Wu, Y., Lemmon, Z.H., Xu, G., Huang, C., & Tian, F. (2018). Genome-wide analysis of transcriptional variability in a large maize-teosinte population. Molecular Plant, 11(3), 443-459.
Weiberg, A., & Karlovsky, P. (2009). Components of variance in transcriptomics based on electrophoretic separation of cDNA fragments (cDNA‐AFLP). Electrophoresis, 30(14), 2549-2557.
Wimalasekera, R., Villar, C., Begum, T., & Scherer, G.F.E. (2011b). Copper amine oxidase1 (CuAO1) of Arabidopsis thaliana contributes to abscisic acid and polyamine-induced nitric oxide biosynthesis and abscisic acid signal transduction. Molecular Plant, 4, 663–678.
Wimalasekera, R., Tebartz, F., & Scherer, G.F. (2011a). Polyamines, polyamine oxidases and nitric oxide in development, abiotic and biotic stresses. Plant Science, 181, 593–6.
[1]. Cadaverine
[2]. Polyamines
[3]. Lysine
[4]. Diamine oxidase
[5]. Lethal Temprature 50
[6]. Perchloric acid (CLO4H)
[7]. 1,7-diaminoheptane
[8]. Dansyl chloride
[9]. NN-dimethylaniline
[10]. 4-aminoantiprine