miRNAها مجموعهای از مولکولهای کوچک RNA غیرکد کننده و درونزاد، با طول حدود 22 نوکلئوتید هستند که در تنظیم پس از رونویسی از طریق تخریب mRNAهای هدف و یا سرکوب ترجمه آنها، نقش دارند. این مولکولها بهصورت تکاملی در قلمرو گیاهی حفاظت شده هستند؛ از این رو، با استفاده از ابزارها و روشهای مقایسهای میتوان آنها و همچنین ژنهای هدف آنها را پیشگویی کرد. در مطالعه حاضر، از روشهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی و همچنین توالیهای EST دو گونه کاسنی و miRNA موجود در بانکهای اطلاعاتی، جهت شناسایی miRNAها و ژنهای هدف آنها در دو گونه C. intybus و C. endivia استفاده شد. این توالیها در ابتدا Blastn شدند و در نهایت و پس از طی مراحل مختلف، چهار miRNA متعلق به خانوادههای miR166، miR162، miR156 و miR393 شناسایی شد. همچنین تعداد زیادی ژن از جمله TIR1، ژنهای پروتئینهای متصل شونده به پروموتر Squamusa و ... بهعنوان ژنهای هدف این miRNAها شناسایی شدند. نتایج Real Time PCR نشان داد که بیان miR156 در برگ گونه C. endivia، بیشتر از گل آن و همچنین بالاتر از بیان این miRNA در برگ و گل گونه C. intybus است.