%0 Journal Article %T شناسایی microRNA (miRNA)ها و ژن‌های هدف آن‌ها در دو گونه Cichorium intybus و Cichorium endivia %J علوم گیاهان زراعی ایران %I دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران %Z 2008-4811 %A چهاربنیچه فرجی, محمد %A نقوی, محمدرضا %A سبکدست نودهی, منیژه %A نصیری, جابر %D 2021 %\ 09/23/2021 %V 52 %N 3 %P 1-10 %! شناسایی microRNA (miRNA)ها و ژن‌های هدف آن‌ها در دو گونه Cichorium intybus و Cichorium endivia %K بیوانفورماتیک %K ریل تایم PCR %K کاسنی %K EST %K miRNAها %R 10.22059/ijfcs.2020.252435.654449 %X miRNAها مجموعه­ای از مولکول­های کوچک RNA غیرکد کننده­ و درونزاد، با طول حدود 22 نوکلئوتید هستند که در تنظیم پس از رونویسی از طریق تخریب mRNAهای هدف و یا سرکوب ترجمه آن‌ها، نقش دارند. این مولکول­ها به‌صورت تکاملی در قلمرو گیاهی حفاظت شده هستند؛ از این رو، با استفاده از ابزارها و روش­های مقایسه­ای می­توان آن‌ها و همچنین ژن­های هدف آن‌ها را پیشگویی کرد. در مطالعه­ حاضر، از روش­های بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی و همچنین توالی­های EST دو گونه کاسنی و miRNA موجود در بانک­های اطلاعاتی، جهت شناسایی miRNAها و ژن­های هدف آن‌ها در دو گونه C. intybus و C. endivia استفاده شد. این توالی­ها در ابتدا Blastn شدند و در نهایت و پس از طی مراحل مختلف، چهار miRNA متعلق به خانواده­های miR166، miR162، miR156 و miR393 شناسایی شد. همچنین تعداد زیادی ژن از جمله TIR1، ژنهای پروتئین­های متصل شونده به پروموتر Squamusa و ... به‌عنوان ژن­های هدف این miRNAها شناسایی شدند. نتایج Real Time PCR نشان داد که بیان miR156 در برگ گونه C. endivia، بیشتر از گل آن و همچنین بالاتر از بیان این miRNA در برگ و گل گونه C. intybus است. %U https://ijfcs.ut.ac.ir/article_82443_9e455220373b796fcd180c8e909b4885.pdf